一直以来，重复征税、过路过桥费成本高这两个问题是物流业发展中的主要阻碍，也是物流业改革中的难点。国家相关的改革一直在推进，但由于涉及部门较多、此前改革缺乏统一的规划和改革思路，改革进度缓慢。
以“过路过桥费成本高”为例，据中国物流与采购联合会统计的数据，我国物流企业过路过桥费的支出大概占到总成本的三分之一，过高的路桥费，增加了企业运营成本，影响到车辆正常通行，降低了物流效率。
针对这个问题，此次《意见》提出，要加大对高速公路收费的监管力度，撤并不合理的收费站点，逐步降低偏高的高速公路收费标准，对已出让经营权的繁忙路段，应根据政府财力状况逐步回购经营权。
http://www.changshawl.cn/zhuanxianseven.htm 虽然此前国家已经开始对收费公路进行清理，但由于收费公路的收费标准涉及地方利益，且地方收费公路多为地方融资平台贷款修建，如果降低公路收费标准，可能会影响到地方融资平台的资金流。
在当前地方债务规模较大、风险隐现的背景下，国家能否在较大范围内降低收费公路的收费标准，不仅仅取决于改革的决心。
如果国家仅对某条收费公路的收费进行调整，这也可能会引起车流量过于集中到收费标准较低的公路上来，对公路整体的运营效率也会有影响。此外，现行营业税在物流环节中不同环节的税率不一致，容易产生重复征税的问题，也不利于物流行业的整体发展，一直为外界所诟病。
据了解，以营业税改革为契机的物流行业税收支持政策也已经开始启动。此前有媒体报道，营业税改革试点或选取在上海，物流行业在包括在试点行业内。
http://www.changshawl.cn/zhuanxianeight.htm 但是从整体来看，由于营业税为地方主要税种，营业税向增值税的转型，也将涉及到中央和地方的利益争夺，改革难度可想而知。
而土地资源支持、行政审批简化等问题，在此次《意见》中也有提及。《意见》明确，支持政策涵盖税收、土地资源、公路收费、行政审批程序简化、行业资源整合、创新技术应用、资金扶持以及农产品物流等八个方面的政策措施。改革也更为可期。
物流业作为一个主要服务于制造、建筑及零售三大行业的附属行业，成长性与这些行业及国民经济总量变化关系密切。
